ระหว่าง ปี พ.ศ.2539 สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ทรงพระราชทานคอมพิวเตอร์พร้อมเครื่องสแกนเนอร์ ให้พิพิธภัณฑ์พืช คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ และให้โครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริ สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา สยามบรมราชกุมารี (อพ.สธ.) ร่วมกับพิพิธภัณฑ์ คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ จัดถ่ายภาพตัวอย่างพรรณไม้แห้งที่รวบรวมไว้มากกว่า 20,000 ตัวอย่าง แล้วจัดบันทึกลงแผ่น CD-ROM พร้อมทั้งโปรดเกล้าฯ พระราชทานแผ่นบันทึกชุดนี้แก่มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ เมื่อวันที่ 21 มิถุนายน 2544 ในคราวเสด็จเป็นองค์ประทานในพิธีเปิดนิทรรศการ “ทรัพยากรไทย : อนุรักษ์และพัฒนาด้วยจิตสำนึกแห่งนักวิจัยไทย” 21-27 มิถุนายน 2544 ณ ศาลา พระเกี้ยวจุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย นอกจากนี้มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ยังได้ส่งบุคลากรร่วมปฏิบัติงานสำรวจตาม โครงการสำรวจหมู่เกาะและทะเลไทยในอ่าวไทยและทะเลอันดามัน โดยปฏิบัติงานร่วมกับโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชในพระราชดำริฯ สวนจิตรลดาและกองทัพเรือตั้งแต่ปี พ.ศ. 2542 และเพื่อเป็นการสานต่อพระราชปณิธานแห่งองค์พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว และสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ในการอนุรักษ์พันธุกรรมพืช มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ได้ทำหนังสือขอพระราชทานพระราชวโรกาสขอสนองพระราช ดำริในโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริฯ และได้รับพระราชานุญาตให้แต่งตั้งคณะกรรมการดำเนินงานโครงการอนุรักษ์พันธุ กรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริฯ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ และในปีงบประมาณ 2553 โครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริ สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ได้มอบหมายให้มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์เข้าสำรวจทรัพยากรกายภาพและชีวภาพใน พื้นที่ปกปักพันธุกรรมพืชเขื่อนรัชชประภา จ.สุราษฎร์ธานี ซึ่งมีเนื้อที่ประมาณ 1,400 ไร่

มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ แบ่งกลุ่มการสำรวจในพื้นที่ทรัพยากรกายภาพและชีวภาพในพื้นที่ปกปักพันธุกรรมพืชเขื่อนรัชชประภา จ.สุราษฎร์ธานี ทั้งหมด 8 กลุ่มเรื่อง ประกอบด้วย

1. การสำรวจทรัพยากรกายภาพและสิ่งแวดล้อม
2. การสำรวจพืชพรรณและป่าไม้
3. การสำรวจทรัพยากรสัตว์ป่า
4. การสำรวจทรัพยากรชีวภาพในน้ำ
5. เห็ด รา จุลินทรีย์
6. สมุนไพร
7. ภูมิปัญญาท้องถิ่น
8. การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ภายในระบบนิเวศน์

ซึ่งมีโครงการที่ร่วมเสนอรวมทั้งสิ้น 38 โครงการ ได้รับทุนสนับสนุนจากเงินงบประมาณแผ่นดินเพื่อดำเนินงาน มีทีมวิจัยที่ร่วมสำรวจพื้นที่ครั้งนี้ประกอบด้วยอาจารย์ ผู้ช่วยวิจัย นักศึกษา และผู้ที่เกี่ยวข้อง จำนวนทั้งสิ้นกว่า 100 คน จากวิทยาเขตหาดใหญ่ และวิทยาเขตสุราษฎร์ธานี และมีระยะเวลาการดำเนินงานของโครงการ ตั้งแต่ปีงบประมาณ 2553 – 2557 รวมงบประมาณที่ดำเนินงานทั้งสิ้น 16,520,855 บาท

แผนแม่บทโครงการ อพ.สธ. – กฟผ. - ม.อ.